FreeNAS hỗ trợ hệ thống tệp OpenZFS cung cấp tính năng kiểm tra tính toàn vẹn của dữ liệu để ngăn chặn việc sửa đổi dữ liệu, cho phép đồng thời sao chụp dữ liệu, nhân rộng và nhiều cấp độ dự phòng khác bao gồm phân chia, ánh xạ, gộp chung nhiều ổ dĩa thành một (RAID 1 + 0), và ba cấp độ của RAID-Z.